莫高窟最著名的三个窟分别是九层楼、三层楼、藏经洞。莫高窟虽然有众多的石窟,但其中这三个是最有名气的,也是最吸引游客参观游玩的。
九层楼,窟前面的建筑一共有九层,因此而得名,是晚唐时期开始建立,到宋初又重新修建。
三层楼,清朝时期王道士在这里主持修建的,三层楼的特别之处就在于有窟中窟,这是到现在为止所发现为数不多的奇观,因此而非常有名气,成为了人们所向往参观游玩的地方。
藏经洞,在这里珍藏了5万多件珍贵的文物,包括从十六国到宋朝时期的很多文书,纸画,刺绣等,另外还有道经以及儒家的一些经典著作,尤其是很多孤本、绝本在这里都能够找到,具有较高的研究,欣赏价值。